关于论文中的脚注是否会在查重时进行检查，存在不同的说法。
一些观点认为，脚注作为正文的一部分，需要参与查重。然而，只要脚注的格式正确，它就不会在查重报告中被标记为重复内容。这意味着，如果脚注按照标准格式正确插入，查重系统可以识别出它并在查重报告中列出来，这部分内容通常不会被计入正文重复率。但如果脚注的格式存在问题，查重系统可能无法识别出它是脚注内容，从而将其视为正文部分进行查重，这会导致重复率上升。
另一种观点则认为，脚注通常不会参与论文查重。脚注主要用于解释或引用文献资料，其内容不会直接出现在论文的正文中，因此不会对论文查重结果产生直接影响。然而，需要注意的是，一些查重系统可能会将脚注中的引用标记为引用，如果引用过多，可能会被视为问题。
综上所述，虽然脚注本身可能不直接参与查重，但为了确保查重结果的准确性，作者仍然需要确保脚注的格式正确，并避免过度引用。此外，不同的查重系统可能会有不同的规定和处理方式，因此，在提交论文进行查重之前，了解所使用的查重系统的具体规定和要求是非常重要的。
最后，无论脚注是否参与查重，作者都应该确保论文的原创性，并主动进行自我查重和对比，以确保论文的质量。